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核酸片段分選?更準、更快的選擇
近年來(lái),高通量測序技術(shù)已經(jīng)日漸成為基因組學(xué)研究項目的標準。從樣品制備到文庫制備及終測序,大多步驟都要求精|確高效化、易于自動(dòng)化操作,并且許多高通量測序應用都要求核酸片段在特定范圍內緊密分布,因此精|準快速的進(jìn)行片段選擇步驟更具挑戰性。
在進(jìn)行核酸片段分選的過(guò)程中,傳統的瓊脂糖凝膠回收法不適于安全、高通量的操作,使用普通磁珠無(wú)法準確做到片段大小的選擇,而使用Agencourt SPRIselect的片段分選產(chǎn)品可以得到集中的核酸片段分布,并且可以*自動(dòng)化,廣泛應用于:
核酸片段回收
核酸片段篩選
NGS、Sanger測序
qPCR、ddPCR等
Fig 1 Agencourt SPRIselect片段篩選試劑盒進(jìn)行目標片段回收。
Agencourt SPRIselect試劑盒可常溫保存,方便使用。支持高效純化回收核酸片段(Fig 1);同時(shí)可根據SPRIselect磁珠與樣品的比例選擇性結合特定大小的核酸片段,工作流程易于調整且靈活,以快速達到去除小片段、大片段、或去大&去小的目的(Fig 2A)。SPRIselect磁珠優(yōu)先結合大片段核酸,隨著(zhù)磁珠與樣本體積比例增加,磁珠結合更小片段的效率增加,結合更大片段的效率降低。由此,操作人員可以自由選擇需要篩選的片段范圍,以滿(mǎn)足不同核酸長(cháng)度范圍的應用需求(Fig 2B)。
Fig 2 (A) Agencourt SPRIselect片段篩選試劑盒進(jìn)行去除小片段、去除大片段、及目標片段選擇回收。
(B)M: 2100檢測Marker;Shear: 彌散的DNA|片段;0.XX - 0.XX: 片段分選時(shí)去大、去小的磁珠樣本比例。
高通量 、簡(jiǎn)便操作
基于A(yíng)gencourt SPRIselect試劑盒的核酸回收和片段選擇方法,貝克曼的Biomek自動(dòng)化移液站可在1小時(shí)內完成96個(gè)樣本的全自動(dòng)流程,提供包含成熟的自動(dòng)化方法、穩定的試劑、開(kāi)放的耗材等在內的核酸回收和片段選擇體系。
如果需要不同片段范圍的文庫,用戶(hù)可以選擇在多孔反應板中應用多種樣品比率。Biomek自動(dòng)化移液站的靈活八通道加樣器可用于轉移不同體積SPRIselect磁珠和樣本,而多通道加樣器可用于快速批量去除上清液、乙醇并轉移終洗脫的核酸等。
Fig 3 Agencourt SPRIselect 自動(dòng)化核酸回收、選擇操作系統
貝克曼庫爾特為您提供不同規格Agencourt SPRIselect片段篩選試劑盒和使用支持,致力于為用戶(hù)提供更加完整的解決方案。欲了解更多信息,請訪(fǎng)問(wèn)貝克曼庫爾特網(wǎng)站、小貝智選網(wǎng)上商城或聯(lián)系我們。
參考:
1. US Patent 6938987
2. US Patent 6938995