如何應對細胞株系開(kāi)發(fā)數據挑戰

細胞株開(kāi)發(fā)是眾多具有重大數據挑戰的工作流程之一。與任何篩選過(guò)程一樣，樣本通量帶來(lái)了數據量的挑戰。當使用多種分析工具以不同格式生成不同類(lèi)型的數據時(shí)，這就變得更加具有挑戰性。這不僅需要在不同的孔板和孔之間移動(dòng)數據，而且整個(gè)過(guò)程可能會(huì )延長(cháng)數月。在整個(gè)過(guò)程中，必須對數據進(jìn)行追蹤，以確保進(jìn)入生產(chǎn)的任何細胞株都有必要的歷史數據（例如單克隆性的證明），并且為了報告需要，所有的數據都可以被方便地訪(fǎng)問(wèn)。在這里，我們將描述在Biomek i7工作站（圖1）上自動(dòng)化細胞株開(kāi)發(fā)如何克服與此工作流程相關(guān)的許多數據挑戰。

圖1：Biomek i7工作站與三方設備整合一起被用于自動(dòng)化細胞株開(kāi)發(fā)工作流程。

作為液體轉移步驟的一部分，Biomek軟件會(huì )自動(dòng)移動(dòng)數據，因此數據可以隨著(zhù)樣本移動(dòng)而并行移動(dòng)（圖4）。同時(shí)，數據也可以存儲在DART數據庫中，未來(lái)任何時(shí)候掃描孔板條碼時(shí)，相應的數據都會(huì )被自動(dòng)檢索出來(lái)。DART提供了不同時(shí)間交互的方法之間的鏈接（圖4）——在諸如細胞株開(kāi)發(fā)這樣的長(cháng)時(shí)間工作流程中，這是一個(gè)關(guān)鍵組件。

圖3：自動(dòng)化數據處理示意圖。

除開(kāi)存儲和利用數據，DART數據庫可以通過(guò)多種方便的方式訪(fǎng)問(wèn)。為了以用戶(hù)友好的方式進(jìn)行快速可視化，可通過(guò)Chrome瀏覽器直接實(shí)時(shí)查看（圖6A），同時(shí)可以使用DART報告生成器在Excel中生成報告。

圖6：DART數據查看和報告。

在任何實(shí)驗中產(chǎn)生的數據使實(shí)驗有價(jià)值。數據處理中的任何錯誤都可能消除這個(gè)價(jià)值，甚至可能將研究進(jìn)程推向錯誤的方向。對于像細胞株開(kāi)發(fā)這樣長(cháng)達數月的工作流程，數據丟失或錯誤的風(fēng)險更大，因此，確保數據完整性的工具至關(guān)重要。Biomek和DART軟件通過(guò)使數據完整性過(guò)程自動(dòng)化且易于獲取，可以為細胞株開(kāi)發(fā)過(guò)程提供真正的價(jià)值。

想要了解更多關(guān)于數據處理方面的內容，請點(diǎn)擊下圖訪(fǎng)問(wèn)貝克曼庫爾特生命科學(xué)部官|(zhì)網(wǎng)

*以上內容涉及設備僅適用于科研和工業(yè)，不用于臨床診斷。