—— PROUCTS LIST
DO MORE with LESS | 用聲波玩轉單細胞測序
單細胞測序技術(shù)起始核酸材料極少,步驟比普通NGS繁雜,實(shí)驗周期更長(cháng),難度和風(fēng)險也更大。重現性和成功率是一大考驗。單細胞測序方法眾多,除了商品化試劑盒,許多研究人員也會(huì )針對自己關(guān)注的特征開(kāi)發(fā)全新的技術(shù)。另一方面,開(kāi)展腫瘤異質(zhì)性等針對細胞群體的研究越來(lái)越普遍,這需要對大批量細胞進(jìn)行逐一的測序和解析。如果按照試劑盒常量/rxn,手工完成每一個(gè)細胞的實(shí)驗,勞力和成本都難以承受。
Echo硬核的聲波移液技術(shù)技術(shù),通過(guò)能量控制準確的納升級液體轉移,噴射液滴單位可以低至2.5 nL。其非物理接觸、準確小量移液、高速度的特征,決定了Echo非常適合解決單細胞測序中遇到的超高通量、技術(shù)靈活多變、反應scale-down成本控制、交叉污染等問(wèn)題。
非物理接觸
· 樣本完整性
· 無(wú)吸頭消耗
· 降低交叉污染風(fēng)險
移液的靈活性
· 2.5 /25 nL 每滴
· 200-500 滴/秒
· 任意孔至任意孔移液
移液條件溫和
· DNA/RNA/蛋白等生物大分子
以結合SMART-Seq cDNA文庫制備及Nextera XT 測序文庫制備的單細胞RNA-seq實(shí)驗為例。SMART-Seq反應體系(50 uL)可以由Echo縮小4,5,8,10,16,20至32倍,Nextera XT 試劑盒可縮小10倍(50 uL至5 ul)使用。值得注意的是,SMART-seq cDNA文庫制備中,常量反應總體積為50 ul, 縮小32倍后反應總體積僅僅只有1.75 uL,還不及一個(gè)常量反應中逆轉錄酶使用量大。借助Echo,一個(gè)96 rxn的試劑盒將具備完成3072 rxn的可能。
Echo可以完成
● 微量化的單細胞基因組放大3
● 微量化的單細胞測序文庫制備
● 微量化的文庫濃度質(zhì)控
● 一步法文庫Normalization&Pooling
● Better together—— Echo plus Biomek自動(dòng)化單細胞測序方案
基于Echo的單細胞文庫制備不受待測細胞數目的限制,支持各種試
Better together—— Echo plus Biomek自動(dòng)化單細胞測序方案
基于Echo的單細胞文庫制備不受待測細胞數目的限制,支持各種試劑盒的靈活組合和NGS建庫方法學(xué)DIY。做你想做的,測你想測的,提供scale-down的微量化反應體系和scale-up的自由度。
將Echo聲波移液工作站與Biomek i-系列自動(dòng)化工作站結合,可實(shí)現更高自動(dòng)化程度的單細胞測序實(shí)驗。Echo完成文庫制備中涉及的微量化反應體系構建, 由Biomek自動(dòng)化工作站配合實(shí)現文庫 Agencourt SPRIselect磁珠PCR clean-up和片段篩選。實(shí)驗流中產(chǎn)生的數據均可查可溯,保證文庫信息安全可靠。
參考:
1. US Patent 6938987
2. US Patent 6938995